维普查重系统是一个专门用于学术论文查重的工具，其主要目的是帮助用户检测论文中可能存在的抄袭和重复内容。在进行查重时，维普查重系统会对论文的整体内容进行比对，同时也会对参考文献进行一定程度的检测。根据用户的反馈和系统的使用说明，维普查重系统在查重时会将参考文献部分与数据库中的文献进行比对，以确保引用的文献符合学术规范。因此，虽然维普查重系统的主要功能是查重正文部分，但它在一定程度上也会关注参考文献的准确性和规范性。特别是在一些高标准的学术期刊中，参考文献的格式和引用的准确性是非常关键的，维普查重系统可以帮助用户识别可能存在的问题。此外，维普查重系统还提供了详细的查重报告，用户可以通过这些报告了解到论文的重复率、相似部分以及参考文献的使用情况，这对于提高论文的质量和学术价值是非常有帮助的。

在使用维普查重系统时，用户常常会关心参考文献部分是否会被查重。根据该系统的设计，参考文献的查重主要是为了确保引用的文献是准确的，且符合学术规范。维普查重系统会对论文的参考文献进行一定的比对，以检查是否存在抄袭或者不当引用的情况。用户在提交论文时，系统会自动分析文献列表，与数据库中的信息进行比对，从而判断引用是否符合标准。值得注意的是，虽然维普查重系统会对参考文献进行一定的查重，但其重点仍然是在正文内容的查重。因此，用户在撰写论文时，除了关注正文的原创性外，也应重视参考文献的准确性和格式规范。为了避免在查重中出现问题，建议用户在使用维普查重系统之前，仔细检查参考文献的格式，确保所有引用的文献都符合相关的学术标准。这样不仅可以提高论文的通过率，还可以提升学术写作的水平。